小鼠骨髓衰老的功能特征分析和靶点发掘
Functional characterization and main target discovery of bone marrow aging in mice
摘要目的 本研究旨在建立一种基于RNA测序阐明衰老过程中小鼠骨髓组织参与主要功能活动和细胞过程的特征性变化的研究方案,发掘用于衰老预测和干预的代表性潜在靶点.方法 提取来自2、10和18月龄的各3只C57BL/6J雄鼠双侧胫骨和股骨的骨髓细胞,经过红细胞裂解处理后提取RNA用于RNA测序分析.结果 基因表达量和Venn分析的结果显示2~10月龄基因的表达变化以下调为主,10~18月龄则以上调为主,在小鼠成熟发育的过程中基因表达经历了由下调为主向上调为主的变化.通过京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的功能和富集分析以及基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)关注到的不同年龄阶段小鼠骨髓组织在"免疫系统""发育和再生""运输和分解代谢""细胞生长和死亡"等通路存在显著的表达差异,其中在炎症、细胞骨架和DNA修复通路表现出持续激活,与逐渐下降的造血功能和波动的免疫调节形成对比.通过富集通路筛选出的差异表达上调的基因Bmpr1a 和Inhba之间、差异下调的 Dntt 和 Ccnd1 之间以及 Col1a1、Col1a2、Fcgr1、Fyn、Lgmn、Ctsl、Ctsk、Ctss、Gnail、Myl4和Ccr5之间均存在相互作用,参与HSCs稳态、细胞周期、DNA损伤修复、免疫调节、细胞凋亡等功能调控.结论 本研究提供了不同年龄阶段骨髓组织转录水平基因表达变化的数据,为探究小鼠衰老中骨髓组织发生的主要特征性变化提供研究策略,发掘揭示衰老的相关基因和信号通路,为延缓衰老和预防衰老相关疾病提供新的策略.
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