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金黄色葡萄球菌肠毒素A蛋白的B细胞表位的预测

Prediction of the B-cell epitopes for staphylococcus enterotoxin A protein

摘要目的 预测金黄色葡萄球菌肠毒素A蛋白(SEA)的B细胞表位.方法 以金黄色葡萄球菌合肥乳源分离株M3基因组DNA为模板,PCR扩增SEA基因并进行序列测定与分析.应用DNAstar protean软件对SEA蛋白的二级结构、柔性、亲水性、表面可能性和抗原指数等多参数进行综合分析,预测其B细胞表位.结果 M3分离株的SEA基因全长774 bp,编码由257个氨基酸组成的相对分子量为29.67 kDa的SEA蛋白,M3分离株SEA基因与标准株的核苷酸序列与氨基酸序列同源性分别为98.7%和98.4%.SEA蛋白的优势B细胞表位位于肽链的第64~ 68、100~107、138~141、156~160、166 ~ 173、213~217和237~244区段.结论 预测出SEA蛋白的7个优势B细胞表位,为进而克隆表达表位蛋白,制备针对SEA表位的单克隆抗体奠定了基础.

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中国微生态学杂志

中国微生态学杂志

2012年24卷1期

15-18页

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