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肝癌实时定量RT-PCR中适宜内参基因的选择

Selection of optimal internal reference genes in human hepatocellular carcinoma using real-time quantitative RTPCR

摘要目的 探计肝癌(HCC)组织及细胞系实时定量RT-PCR最佳的内参基因选择.方法 通过实时定量RT-PCR,检测HMBS、CTBP1、HPRT1、UBC、B2M、SDHA、RPLI3A、EIF4A1、TUBB、YWHAZ、ACTB、GUSB、GAPDH、18 s rRNA和28 s rRNA 15个内参基因在70例HCC、癌旁肝组织及阿法替尼作用后4个HCC细胞系的表达情况.并使用NormFinder及geNorm软件分析最优化的内参基因.结果 15个内参基因表达存在差异,Cq值在8~29.2间.GAPDH在HCC及癌旁肝组织表达差异有显著性(P<0.05).结论 NormFinder及geNorm软件均显示HMBS+UBC组合为肝组织的最佳内参,HMBS+ RPLI3A组合为体外肝癌细胞系的最适宜内参.

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