SELDI-TOF/MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱
Serum proteome fingerprinting of hepatocellular carcinoma after TACE treatment using SELDI-TOF/MS
摘要目的 分析原发性肝癌患者经导管肝动脉化疗栓塞(TACE)治疗后血清蛋白质指纹图谱的变化.方法 应用SELDI-TOF/MS技术和IMAC 30蛋白质芯片采集50例肝癌患者TACE治疗前后肝癌患者的血清蛋白质质谱,Biomarker Wizard软件分析差异表达蛋白质峰,应用支持向量机(support vector machine,SVM)建立TACE治疗前后分类模型,ROC评价各差异蛋白质峰和SVM分类模型的分类效率.结果 在0~20 000m/z质荷比范围内,共采集到199个蛋白质峰,BiomarkerWizard软件鉴定出13个差异表达蛋白质峰(P<0.05),包括TACE治疗24 h后7个高表达蛋白质峰和6个低表达蛋白质峰.2 883、11 535和11 687等3个蛋白质峰区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性分别为80%、76%、62%和80%、60%、62%,AUC为0.8;SVM分类模型区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性均为100%.结论 应用SELDI-TOF/MS技术可分析TACE治疗后血清差异表达蛋白质谱,SVM分类模型能有效区分TACE治疗前后HCC.
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