换一批6个猪品种CD53基因中结构变异SV184分布频率的研究
Study on Distribution Frequency of Structure Variation SV184 in CD53 Gene of Six Pig Breeds
摘要基于香猪全基因组重测序数据,在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异(structure variant,SV)184,为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化,本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物,采用PCR方法对猪群中SV184的分布频率进行比较研究,应用RT-PCR技术,分析CD53基因的原初转录本序列结构,研究SV184对CD53基因的转录是否有直接影响.结果显示,6个猪品种中SV184的分布频率存在明显差异,香猪以VN基因型为主,其他5个猪品种是NN基因型占优势;计算两种等位基因的频率,香猪以缺失的V等位基因为主,其他5个猪品种以正常的N等位基因为主.选择3种基因型个体的血液样本,逆转录后分析CD53基因的原初转录本的序列,从中检测到缺失型和不缺失的两种转录本形式,提示SV184对CD53基因的转录无直接影响.SV184可作为分子标记用于区分香猪和其他猪品种.
更多相关知识
分类号
S828.8
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.04.020
发布时间
2017-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家高技术研究发展计划（863计划）（2013AA102503）
贵州省农业科技攻关计划（NY(2013)3073）
贵州省百层次创新型人才项目（2016-4012）
国家自然科学基金（31672390）
- 浏览2
- 被引2
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
