换一批一株孔雀源奇异变形杆菌全基因组测序及毒力与耐药性分析
Whole Genome Sequencing and Virulence and Drug Resistance Analysis of a Strain of Proteus mirabilis Derived from Peacock
摘要[目的]试验旨在了解分离自蓝孔雀的奇异变形杆菌PM19的毒力、耐药性以及基因组特征.[方法]采用动物试验、药敏试验和PCR方法对分离菌进行毒力、耐药性以及毒力基因检测,并运用Illumina NovaSeq6000平台进行基因组框架图测序,通过NR、KEGG、Swiss-Prot、COG、PHI-base、CAZy、CARD和VFDB数据库进行功能基因注释以及病原宿主互作用蛋白、碳水化合物活性酶、耐药基因和毒力因子预测分析.[结果]分离菌PM19为多重耐药菌,对受试的氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸钾、头孢曲松、头孢噻肟、阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素、环丙沙星、四环素、强力霉素、磺胺嘧啶钠、替米考星、氟苯尼考和氯霉素共14种抗菌药物全部耐药.分离菌具有较强毒力,对小鼠半数致死量为 6.19×106 CFU.FliL、zapA、rsmA、hmpA、mrpA、atfA、pmfA 和 ureC 共 8 种毒力基因在该菌中被检测到.全基因组测序分析显示,该菌基因组大小约为3.98 Mb,GC含量为38.94％,预测到3 715个编码基因.PHI-base数据库注释出158个与病原宿主互作用有关的蛋白基因;CAZy数据库注释出101个碳水化合物活性酶基因;通过CARD数据库和VFDB数据库分别注释到92个耐药基因和8类毒力相关基因.[结论]奇异变形杆菌PM19菌株具有较强毒力且为多重耐药菌株,携带大量病原宿主互作用蛋白基因、碳水化合物活性酶基因、耐药基因及毒力基因.
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分类号
S852.61+2
栏目名称
DOI
10.16431/j.cnki.1671-7236.2024.07.028
发布时间
2024-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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