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拉米夫定治疗前后HBV全基因序列检测对比

The cloning and comparative study of full-length HBV genomes from serums before and after treatment with lamivudine in a patient with hepatitis B

摘要:

目的对比研究同一慢性乙型肝炎患者拉米夫定治疗前及病情急性恶化后乙型肝炎病毒(HBV)株的结构基因组.方法对治疗前及出现病情急性恶化后的慢性乙型肝炎患者的两株HBV全基因进行克隆、测序,分析各读码框架核苷酸和氨基酸的变化.结果出现病情急性恶化后的HBV株与治疗前毒株比较,共有30个氨基酸发生替代(包括YMDD基序的M550V变异和上游的L526M变异),P、X、S和PreC/Core 4个开放读码框架的替代氨基酸数(变异率)分别为10(1.2%)、4(2.6%)、8(2.0%)和8(3.8%),氨基酸总变异率为1.9%.其中,HBV PreC区的第1898位核苷酸发生G→A变异,产生一个终止密码子,导致HBeAg缺失;PreS2的起始密码子出现ATG→ATA变异,可致PreS2表达缺陷;另有变异位点分布于已知CTL、B和T细胞的细胞表位.结论对拉米夫定耐药并致病情急性恶化的HBV株在YMDD基序之处共有29个氨基酸变异.

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