多组学分析HAPLN1与肝癌预后及免疫细胞浸润关系
Multiomic analysis of the relationship between HAPLN1 and prognosis of hepatocellular carcinoma and immune cell infiltration
摘要目的:分析透明质酸和蛋白聚糖连接蛋白1(HAPLN1)表达与肝细胞癌(肝癌)患者预后的关系,并探讨其与肝癌免疫细胞浸润的关系。方法:基于TCGA数据库分析HAPLN1在肝癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系。通过Cox单因素和多因素分析筛选与肝癌预后相关的危险因素。构建列线图模型对生存预后进行量化分析,ROC曲线评估HAPLN1对肝癌患者预后的预测价值。采用Cluster Profile软件包对肝癌HAPLN1高、低表达组的差异表达基因对应的通路和细胞功能进行基因本体论分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。利用基因集富集分析?(GSEA)对HAPLN1相关通路进行可视化。采用CIBERSORT核心算法评估肝癌中HAPLN1与24种免疫细胞的相关性,采用ssGSEA算法评估24种免疫细胞在HAPLN1高、低表达组肝癌中的富集情况,进一步探讨肝癌中免疫检查点与HAPLN1的相关性。结果:TCGA数据库分析显示,HAPLN1在肝癌组织中上调,且与配对正常肝组织相比,肝癌组织的HAPLN1表达明显高于正常肝组织(P=0.002),HAPLN1高表达的肝癌患者总生存期更低(HR=1.560,95%CI:1.100~2.218;P=0.013)。HAPLN1表达与T分期、血管侵犯和病理分级显著相关(χ2=9.149,9.518,6.614;P<0.05)。Cox多因素回归分析显示,T分期(HR=2.622,95%CI:1.692~4.062;P<0.001)和HAPLN1表达(HR=1.622,95%CI:1.072~2.585;P=0.023)是肝癌患者预后的独立危险因素。预后列线图分析显示,HAPLN1对于肝癌预后具有较好的预测价值(AUC=0.737,95%CI:0.685~0.788)。GO和KEGG富集分析显示,HAPLN1的差异表达基因主要富集于顶部质膜、信号受体激活和信号配体活性功能以及胆汁分泌等功能通路;免疫细胞相关性分析显示,HAPLN1与多种免疫细胞密切相关,且与多种免疫检查点呈正相关。结论:HAPLN1高表达的肝癌患者预后更差,基于HAPLN1表达联合病理TNM分期构建的列线图模型为预测肝癌患者预后提供了有效参考。HAPLN1可能通过调控肿瘤免疫微环境促进肝癌进展。
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