• 医学文献
  • 知识库
  • 评价分析
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

医学文献>>
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批

早发家族性阿尔茨海默病患者线粒体基因组变异分析

Analysis of mitochondrial genome variation in patients with early-onset familial Alzheimer′s disease

摘要目的:探索线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)变异与早发家族性阿尔茨海默病发病风险的相关性。方法:从2014年3月至2020年4月收集到的早发家族性阿尔茨海默病家系样本中筛选出4个具有母系遗传特征的阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)家系样本,开展mtDNA全序列测序,与修正版的剑桥参考序列比对分析。测序结果根据标准序列记录下每个样本的mtDNA变异位点及相关信息。采用最新版的mtDNA分类系统数据库进行线粒体单倍型类群分类。变异分析方法:根据系统发育树,找出枝端私有变异位点;MitoTool分析变异的保守性;再通过PhyloTree查询突变是否为其他单倍型类群的鉴定变异。通过文献和数据库查询,SIFT致病性预测软件(2015)预测分析。通过I-TASSER 预测蛋白结构,Pymol可视化蛋白结构同源模拟蛋白三级结构分析,分析结构变化。结果:其中一个家系的mtDNA存在稀有非同义变异m.8978T>C,该位点保守系数1.0,致病性分数较高,蛋白结构同源模拟MT-ATP6蛋白三级结构分析,显示该蛋白支链残端的结构改变。结论:mtDNA稀有非同义变异m.8978T>C可能具有潜在的致病性,可能通过线粒体的功能下降影响AD的发病。

更多

abstractsObjectives:To explore the mutations in mitochondrial DNA (mtDNA) and the risk of developing early-onset Alzheimer′s disease(AD).Methods:From March 2014 to April 2020, four pedigrees with maternal inherited characteristics of AD were recruited from the collected pedigree samples of early-onset familial AD. The entire mtDNA sequence was sequenced and compared with the modified Cambridge reference sequence. The latest version of mtDNA classification system database was used to classify mitochondrial haplotypes. Variation analysis method: the phylogenetic tree was used to find out the branch end private variation sites of each family sample proband, the MitoTool was used to analyze the conservatism of variation, and the PhyloTree was used to check whether these mutations were the identification variation of other haplotype groups. The pathogenicity of these variants was predicted by literature and database search, and SIFT pathogenicity prediction (2015). I-TASSER was used to predict the protein structure and Pymol was used to visualize the protein structure homology and to simulate the tertiary protein structure for analysis of the protein structural change.Results:A rare and non-synonymous variation m.8978T>C was detected. The conservative coefficient of this site was 1.0, and the pathogenicity score was high. The tertiary structure of MT-ATP6 protein was simulated by homology analysis, which showed the structural changes of the branched chain residues.Conclusion:Mutation m.8978T>C of mtDNA may have potential pathogenicity and affect the onset of AD through the decline of mitochondrial function.

More
广告
  • 浏览0
  • 下载0
中华精神科杂志

中华精神科杂志

2021年54卷5期

325-330页

ISTICPKUCSCDCA

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

扩展文献

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷