换一批
换一批摘要目的 通过基因表达综合(GEO)数据库微阵列分析,筛选出重要的肺纤维化相关泛素化基因,探讨其在肺纤维化大鼠肺组织中表达情况及作用.方法 采用GEO数据库中GSE47460和GSE70866两个数据集,利用R语言limma包获取肺纤维化组和正常对照组间差异表达基因(DEGs).从DEGs中选出泛素化相关基因,利用Cytoscape软件筛选关键(Hub)基因,并对后者进行GO和KEGG富集分析、Kaplan-Meier分析差异表达基因生存率.同时,构建博来霉素(BLM)诱导肺纤维化大鼠模型,通过蛋白免疫印迹(WB)检测肺纤维化大鼠肺组织Hub基因表达情况.结果 筛选出38个泛素化相关的DEGs,5个是泛素化相关的Hub基因,其中UCHL1是肺纤维化较好的生存预测基因,其在肺纤维化组大鼠肺组织中的表达也较正常组升高(P<0.05),抑制UCHL1可明显改善肺纤维化.结论 泛素化相关Hub基因可能参与肺纤维化进程,其中UCHL1在肺纤维化过程中发挥重要作用,有望成为肺纤维化治疗的分子靶点和诊断性生物标志物.
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关键词
肺纤维化泛素化差异表达基因生物信息学分析Pulmonary fibrosisUbiquitinationDifferentially expressed genesBioinformatics analysis
栏目名称
论著
发布时间
2023-09-05
基金项目
国家自然科学基金
浙江省医药卫生科技计划项目
温州市科技基础性科研项目
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