丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6猴同源基因N的克隆化与序列分析-论文-万方医学网

丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6猴同源基因N的克隆化与序列分析

Cloning and Sequence Analysis of a Monkey Gene Homologous to Human Hepatitis C Virus Core Protein-binding Protein 6 by Bioinformatics

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摘要：

目的:利用酵母双杂交技术,业已成功克隆了人类丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合蛋白6(HCBP6)的编码基因.为了阐明不同生物类型中HCBP6基因序列的同源性,阐明HCBP6的生物学功能,我们应用生物信息学技术,克隆猴HCBP6同源基因序列,并对其结构进行分析.方法:应用我们克隆的人HCBP6基因序列作为参照,对美国国立卫生研究院(NIH)国立医学图书馆(NLM)国立生物工程信息中心(NCBI)建立的核苷酸数据库以及在线分析软件进行分析.对已经克隆的不同生物来源的HCBP6的同源基因序列进行比较.结果:猴HCBP6的同源基因开放读码框架长度为570 bp,编码产物HCBP6蛋白由189aa组成.猴HCBP6的同源基因编码产物与人、猪、牛的HCBP6同源基因编码产物的同源性分别是96.27％、89.95％、85.71％.结论:生物信息学技术是克隆不同生物类型的同源基因序列的可靠、快捷途径.猴HCBP6同源基因的克隆化为研究不同种属来源的HCBP6基因的结构域功能、表达与调控等研究奠定了基础.

作者：成军 ^[1] 李克 ^[1] 王琳 ^[1] 刘妍 ^[1] 钟彦伟 ^[1] 李莉 ^[1]

作者单位：中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室,北京,100039 ^[1]

期刊：《中西医结合肝病杂志》2003年13卷6期 349-351页 ISTIC

关键词：分子生物学生物信息学肝炎病毒,丙型核心蛋白结合蛋白酵母双杂交技术

主题词：蛋白(Egg White)基因(Genes)计算生物学(Computational Biology)肝炎病毒属(Hepacivirus)序列分析(Sequence Analysis)

分类号： R512

栏目名称： 基础理论研究

DOI： 10.3969/j.issn.1005-0264.2003.06.011

发布时间： 2005-11-03

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