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基于蛋白质相互作用网络的甲型流感病毒宿主因子预测

摘要本文对甲型流感病毒(IAV)-人类相互作用从蛋白质层面进行了网络分析.研究发现,IAV强烈倾向于与具有特定拓扑特征和生物功能的人类蛋白质结合.基于这些拓扑特征和生物特征,应用支持向量机结合遗传算法建立了识别模型.基于留一法交叉验证,总预测精度为71.4%.将该模型用于9706个人体蛋白质,最终从人体相互作用组中识别了1418个新的靶标基因,其中部分基因已经被证实在IAV感染中起了重要作用.

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