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云南宣威肺癌组织中LncRNAs的初步筛选和表达验证

摘要目的:筛选云南宣威肺癌组织中表达差异的长链非编码RNA(LncRNAs),并对筛选出来的LncRNAs进行表达验证,为进一步研究宣威肺癌的发生机制提供实验基础和理论依据。 方法:利用高通量LncRNAs芯片筛选5对宣威肺癌组织中差异表达的LncRNAs和mRNA,得到关键LncRNAs,应用RT-PCR对筛选出的LncRNAs进行表达验证,进一步检测基因芯片的准确性。 结果:以LncRNAs芯片结果为基础,根据差异倍数≥2和原始信号值≥50,初步筛选出367个异常表达的LncRNAs和1038个异常表达的mRNA.通过LncRNAs和mRNA共表达分析后筛选出6个具有研究价值的LncRNAs分子,其中表达上调的有3个(SGOL1-AS1、SNHG4、PVT1),表达下调的有3个(FENDRR、H19、PWRN1),应用RT-PCR技术检测33对宣威肺癌患者组织中6个LncRNAs的表达水平,结果与芯片结果一致,表明芯片结果可靠。并对33个患者的临床病例资料进行统计分析,研究其与LncRNAs的相关性。结果显示6个LncRNAs分子的表达差异水平与患者的性别、年龄、吸烟史、淋巴结转移情况、临床分期和组织学类型无明显相关性。而PWRN1的表达差异水平与患者肿块大小有关(P=0.016). 结论:云南宣威肺癌组织和癌旁组织相比,确实存在大量差异表达的LncRNAs, SGOL1-AS1、SNHG4、PVT1在宣威肺癌组织中高表达,而FENDRR、H19、PWRN1在宣威肺癌组织中低表达,提示这些差异表达的LncRNAs可能与云南宣威肺癌的发生发展有关。6个LncRNAs与患者临床指标无明显相关性,而PWRN1的表达差异水平与患者肿块大小有关,提示肿块大小可能与引起PWRN1表达呈负相关关系。本研究为进一步研究云南宣威肺癌发生发展机制提供一定的实验基础和理论依据。

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