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摘要文昌鱼(amphioxus,lancelet)是现存头索动物亚门(Cephalochordata)动物的总称,全世界这一亚门动物现有31种.中国沿海文昌鱼自南向北广泛分布,已报道的种类有鲁卡偏殖文昌鱼(Asymmetron lucayanum),白氏文昌鱼(Branchiostoma belcheri),马来文昌鱼(B.malayanum),短刀侧殖文昌鱼(Epigonichthys cuhellus)和马尔代夫侧殖文昌鱼(E.maldivensis),其中白氏文昌鱼被分为指名亚种(Branchiostoma belcheri belcheri)和青岛亚种(B.belcheri tsingtauense).近年研究发现,用线粒体DNA分子标记计算得到的这两亚种文昌鱼间的遗传差异均在20％以上,大于一般意义上的种间差异;进一步的形态学比较发现二者在臀前鳍的鳍室形态和数目上差异显著,可以作为区分两个物种的鉴别特征;随后又进行了染色体组形分析,发现两者间的染色体数目不同,前者2n=40,后者2n=36;多方面证据表明,此前被当做白氏文昌鱼的两个亚种,实际上是两个独立的物种,根据动物命名法规,原指名亚种应当保留其种名,即白氏文昌鱼(Branchiostoma belcheri),而青岛亚种(B.b.tsingtauense)为无效亚种名,其有效种名应当是B.japonicum,即日本文昌鱼.此外,用线粒体DNA非编码序列和COXⅠ序列对这两种文昌鱼种群的遗传多样性分析发现,它们这些基因的单倍型多态性(h)均接近1,这些结果表明中国沿 海这两种文昌鱼的遗传多样性程度很高,这是一个重要提示,即文昌鱼资源的保护应着重对其栖息地的保护,而其他不恰当的方法并不能对文昌鱼实现有效的保护.