A polynomial delay algorithm for the enumeration of bubbles with length constraints in directed graphs.

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作者： Gustavo,Sacomoto ^[1] ; Vincent,Lacroix ^[1] ; Marie-France,Sagot ^[1]

作者单位： INRIA Rhône-Alpes, 38330 Montbonnot Saint-Martin, France ; Université de Lyon, 69000 Lyon, France ; Université Lyon 1, Lyon, France ; CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, 69622 Villeurbanne, France. ^[1]

关键词 Alternative splicing Bubbles De Bruijn graphs Enumeration algorithms RNA-seq

DOI 10.1186/s13015-015-0046-4

PMID 26120359

发布时间 2020-09-30

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Algorithms for molecular biology

2015年10卷

20页

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