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首页> BMC bioinformatics> ITD assembler: an algorithm for internal tandem duplication discovery from short-read sequencing data.

ITD assembler: an algorithm for internal tandem duplication discovery from short-read sequencing data.

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第一作者： Navin,Rustagi
第一单位： Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA. Rustagi@bcm.edu.;Department of Statistics, Rice University, Houston, TX, USA. Rustagi@bcm.edu.
作者： Navin,Rustagi [1] ; Oliver A,Hampton [2] ; Jie,Li [3] ; Liu,Xi [4] ; Richard A,Gibbs [2] ; Sharon E,Plon [5] ; Marek,Kimmel [4] ; David A,Wheeler [2]
作者单位： Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA. Rustagi@bcm.edu.;Department of Statistics, Rice University, Houston, TX, USA. Rustagi@bcm.edu. [1] Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.;Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA. [2] Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.;Department of Dermatology, Xiangya Hospital, Central South University, Hunan, China. [3] Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA. [4] Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.;Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.;Department of Pediatrics/Hematology-Oncology, Texas Children's Hospital, Houston, TX, USA. [5]
关键词 AMLAssemblyCancer geneticsClusteringData miningDe Bruijn graphsFLT3Somatic mutationsTandem duplication
主题词 算法(Algorithms);外显子(Exons);人类(Humans);白血病, 髓样, 急性(Leukemia, Myeloid, Acute);分子诊断技术(Molecular Diagnostic Techniques);突变(Mutation);串联重复序列(Tandem Repeat Sequences);fms样酪氨酸激酶3(fms-Like Tyrosine Kinase 3)
DOI 10.1186/s12859-016-1031-8
PMID 27121965
发布时间 2018-12-02
提交
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BMC bioinformatics

BMC bioinformatics

2016年17卷

188页

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