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首页> BMC genomics> RepeatAnalyzer: a tool for analysing and managing short-sequence repeat data.

RepeatAnalyzer: a tool for analysing and managing short-sequence repeat data.

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作者： Helen N,Catanese ^[1] ; Kelly A,Brayton ^[2] ; Assefaw H,Gebremedhin ^[3]

作者单位： School of Electrical Engineering and Computer Science, Washington State University, Pullman, Washington, 99164, USA. ^[1] Department of Veterinary Microbiology and Pathology, Washington State University, Pullman, Washington, 99164, USA. ^[2] School of Electrical Engineering and Computer Science, Washington State University, Pullman, Washington, 99164, USA. assefaw@eecs.wsu.edu. ^[3]

关键词 Anaplasma marginale Genetic diversity Genotyping Knuth-Morris-Pratt algorithm Msp1a RepeatAnalyzer Short sequence repeat (SSR)Software tool Visualization

主题词边缘无形体(Anaplasma marginale);计算生物学(Computational Biology);遗传变异(Genetic Variation);基因组学(Genomics);基因型(Genotype);微卫星重复(Microsatellite Repeats);结果可重复性(Reproducibility of Results);软件(Software);肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)

DOI 10.1186/s12864-016-2686-2

PMID 27260942

发布时间 2020-12-09

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BMC genomics

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