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Computing energy landscape maps and structural excursions of proteins.

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作者： Emmanuel,Sapin ^[1] ; Daniel B,Carr ^[2] ; Kenneth A,De Jong ^[1] ; Amarda,Shehu ^[3]

作者单位： Department of Computer Science, George Mason University, 4400 University Drive, Fairfax, 22030, VA, USA. ^[1] Department of Statistics, George Mason University, 4400 University Drive, Fairfax, 22030, VA, USA. ^[2] Krasnow Institute for Advanced Study, George Mason University, 4400 University Drive, Fairfax, 22030, VA, USA. ^[3] Department of Computer Science, George Mason University, 4400 University Drive, Fairfax, 22030, VA, USA. amarda.@gmu.edu. ^[4] Department of Bioengineering, George Mason University, 4400 University Drive, Fairfax, 22030, VA, USA. amarda.@gmu.edu. ^[5] School of Systems Biology, George Mason University, 10900 University Boulevard, Manassas, 20110, VA, USA. amarda.@gmu.edu. ^[6]

关键词 Energy landscape map Evolutionary algorithm Low-cost paths Mechanical work Multi-basin energy landscape Multi-state protein Nearest-neighbor graph Protein equilibrium dynamics Sample-based representation Structural excursion

主题词算法(Algorithms);聚类分析(Cluster Analysis);计算生物学(Computational Biology);人类(Humans);模型, 分子(Models, Molecular);蛋白质构象(Protein Conformation);蛋白质类(Proteins);热力学(Thermodynamics)

DOI 10.1186/s12864-016-2798-8

PMID 27535545

发布时间 2019-01-12

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BMC genomics

2016年17 Suppl 4卷

546页

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