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Mining Plant Genomic and Genetic Data Using the GnpIS Information System.

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作者： A-F,Adam-Blondon ^[1] ; M,Alaux ^[2] ; S,Durand ^[2] ; T,Letellier ^[2] ; G,Merceron ^[2] ; N,Mohellibi ^[2] ; C,Pommier ^[2] ; D,Steinbach ^[2] ; F,Alfama ^[3] ; J,Amselem ^[2] ; D,Charruaud ^[2] ; N,Choisne ^[2] ; R,Flores ^[4] ; C,Guerche ^[2] ; V,Jamilloux ^[2] ; E,Kimmel ^[2] ; N,Lapalu ^[2] ; M,Loaec ^[2] ; C,Michotey ^[2] ; H,Quesneville ^[5]

作者单位： Research Unit in Genomics-Info UR1164, INRA, Université Paris-Saclay, Versailles, Route de Saint-Cyr, 78026, Versailles Cedex, France. afadam@versailles.inra.fr. ^[1] Research Unit in Genomics-Info UR1164, INRA, Université Paris-Saclay, Versailles, Route de Saint-Cyr, 78026, Versailles Cedex, France. ^[2] Research Unit GQE-Le Moulon UMR 320, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay, CNRS, AgroParisTech, Ferme du Moulon, 91190, Gif-sur-Yvette, France. ^[3] ADRINORD Espace Recherche Innovation, 2 rue des Canonniers, 59800, Lille, France. ^[4] UMR BIOGER, UMR1290, INRA, AgroParisTech, 1 avenue Lucien Bretignières, 78850, Thiverval-Grignon, France. ^[5]

关键词 GMOD genome browser GWAS Genetic resources GnpIS InterMine Markers Phenotypes Polymorphism

主题词计算生物学(Computational Biology);数据挖掘(Data Mining);数据库, 核酸(Databases, Nucleic Acid);真菌(Fungi);遗传变异(Genetic Variation);基因组, 植物(Genome, Plant);全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study);基因组学(Genomics);基因型(Genotype);表型(Phenotype);植物(Plants);用户计算机接口(User-Computer Interface)

DOI 10.1007/978-1-4939-6658-5_5

PMID 27987166

发布时间 2018-04-25

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Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

103-117页

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