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RSAT matrix-clustering: dynamic exploration and redundancy reduction of transcription factor binding motif collections.

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作者： Jaime Abraham,Castro-Mondragon ^[1] ; Sébastien,Jaeger ^[2] ; Denis,Thieffry ^[3] ; Morgane,Thomas-Chollier ^[3] ; Jacques,van Helden ^[1]

作者单位： Aix Marseille Univ, INSERM, TAGC, Theory and Approaches of Genomic Complexity, UMR_S 1090, Marseille, France. ^[1] Aix Marseille Univ, CNRS, INSERM, CIML, Marseille, France. ^[2] IBENS, Département de Biologie, Ecole Normale Supérieure, CNRS, Inserm, PSL Research University, F-75005 Paris, France. ^[3]

主题词算法(Algorithms);氨基酸特征结构(Amino Acid Motifs);氨基酸序列(Amino Acid Sequence);动物(Animals);结合部位(Binding Sites);染色质免疫沉淀法(Chromatin Immunoprecipitation);聚类分析(Cluster Analysis);数据库, 蛋白质(Databases, Protein);高通量核苷酸序列分析(High-Throughput Nucleotide Sequencing);人类(Humans);小鼠(Mice);蛋白质结合(Protein Binding);序列分析, 蛋白质(Sequence Analysis, Protein);转录因子(Transcription Factors)

DOI 10.1093/nar/gkx314

PMID 28591841

发布时间 2022-03-30

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Nucleic acids research

Nucleic acids research

2017年45卷13期

e119页

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