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    首页> BMC genomics> Sequence analysis of European maize inbred line F2 provides new insights into molecular and chromosomal characteristics of presence/absence variants.

    Sequence analysis of European maize inbred line F2 provides new insights into molecular and chromosomal characteristics of presence/absence variants.

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    作者： Aude,Darracq [1] ; Clémentine,Vitte [1] ; Stéphane,Nicolas [1] ; Jorge,Duarte [2] ; Jean-Philippe,Pichon [2] ; Tristan,Mary-Huard [1] ; Céline,Chevalier [3] ; Aurélie,Bérard [1] ; Marie-Christine,Le Paslier [4] ; Peter,Rogowsky [4] ; Alain,Charcosset [5] ; Johann,Joets [1]
    作者单位： Genetique Quantitative et Evolution - Le Moulon, INRA, Université Paris-Sud, CNRS, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France. [1] BIOGEMMA, Chappes, France. [2] MIA, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Paris, France. [3] EPGV US 1279, INRA, CEA, IG-CNG, Université Paris-Saclay, Evry, France. [4] Laboratoire Reproduction et Développement des Plantes, Univ Lyon, ENS de Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, INRA, Lyon, France. [5] Genetique Quantitative et Evolution - Le Moulon, INRA, Université Paris-Sud, CNRS, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France. johann.joets@inra.fr. [6]
    关键词 De novo assemblyDouble strand break repair (DSBR)European germplasmGenetic diversityLinkage disequilibriumMaizeMicrohomology mediated end joining (MMEJ)Pan-genomePresence absence variation (PAV)Structural variation
    主题词 染色体, 植物(Chromosomes, Plant);计算生物学(Computational Biology);DNA拷贝数变异(DNA Copy Number Variations);DNA转座子(DNA Transposable Elements);进化, 分子(Evolution, Molecular);遗传变异(Genetic Variation);基因组, 植物(Genome, Plant);基因组学(Genomics);近亲繁殖(Inbreeding);连锁不平衡(Linkage Disequilibrium);禾本科(Poaceae);序列分析, DNA(Sequence Analysis, DNA);玉米(Zea mays)
    DOI 10.1186/s12864-018-4490-7
    PMID 29402214
    发布时间 2024-03-13
    提交
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    BMC genomics

    BMC genomics

    2018年19卷1期

    119页

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