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Application of alignment-free bioinformatics methods to identify an oomycete protein with structural and functional similarity to the bacterial AvrE effector protein.

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作者： Devdutta,Deb ^[1] ; David,Mackey ^[2] ; Stephen O,Opiyo ^[3] ; John M,McDowell ^[1]

作者单位： Department of Plant Pathology, Physiology and Weed Science, Virginia Tech, Blacksburg, Virginia, United States of America. ^[1] Departments of Horticulture and Crop Science and Molecular Genetics, Ohio State University, Columbus, Ohio, United States of America. ^[2] Molecular and Cellular Imaging Center-Columbus, Ohio Agricultural Research and Development Center, Ohio State University, Columbus, Ohio, United States of America. ^[3]

主题词氨基酸序列(Amino Acid Sequence);拟南芥属(Arabidopsis);细菌蛋白质类(Bacterial Proteins);细胞死亡(Cell Death);计算生物学(Computational Biology);数据挖掘(Data Mining);模型, 分子(Models, Molecular);卵菌纲(Oomycetes);表型(Phenotype)

DOI 10.1371/journal.pone.0195559

PMID 29641586

发布时间 2022-12-07

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