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首页> Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)> Bioinformatics Basics for High-Throughput Hybridization-Based Targeted DNA Sequencing from FFPE-Derived Tumor Specimens: From Reads to Variants.

Bioinformatics Basics for High-Throughput Hybridization-Based Targeted DNA Sequencing from FFPE-Derived Tumor Specimens: From Reads to Variants.

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作者： Shulei,Sun ^[1] ; Sarah S,Murray ^[2]

作者单位： Center for Advanced Laboratory Medicine, University of California San Diego Health, La Jolla, CA, USA. ^[1] Center for Advanced Laboratory Medicine, University of California San Diego Health, La Jolla, CA, USA. shmurray@ucsd.edu. ^[2] Department of Pathology, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA. shmurray@ucsd.edu. ^[3]

关键词 Insertion/deletion (indel)Next-generation sequencing (NGS)Read alignment Single nucleotide variant (SNV)Variant calling

主题词计算生物学(Computational Biology);DNA, 肿瘤(DNA, Neoplasm);高通量核苷酸序列分析(High-Throughput Nucleotide Sequencing);人类(Humans);突变(Mutation);肿瘤(Neoplasms);核酸杂交(Nucleic Acid Hybridization);石蜡包埋(Paraffin Embedding);多态现象, 遗传(Polymorphism, Genetic);RNA, 肿瘤(RNA, Neoplasm);组织固定(Tissue Fixation)

DOI 10.1007/978-1-4939-9004-7_3

PMID 30649719

发布时间 2022-12-07

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Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

37-48页

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