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首页> BMC research notes> An OpenMP-based tool for finding longest common subsequence in bioinformatics.

An OpenMP-based tool for finding longest common subsequence in bioinformatics.

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第一作者： Rayhan,Shikder
第一单位： Department of Computer Science, University of Manitoba, Winnipeg, MB, Canada.
作者： Rayhan,Shikder [1] ; Parimala,Thulasiraman [1] ; Pourang,Irani [1] ; Pingzhao,Hu [2]
作者单位： Department of Computer Science, University of Manitoba, Winnipeg, MB, Canada. [1] Department of Biochemistry and Medical Genetics and The George and Fay Yee Centre for Healthcare Innovation, University of Manitoba, Room 308-Basic Medical Sciences Building, 745 Bannatyne Avenue, Winnipeg, MB, R3E 0J9, Canada. pingzhao.hu@umanitoba.ca.;Department of Computer Science, University of Manitoba, Winnipeg, MB, Canada. pingzhao.hu@umanitoba.ca.;Research Institute in Oncology and Hematology, Winnipeg, MB, Canada. pingzhao.hu@umanitoba.ca. [2]
关键词 DNA sequence alignmentLCS on MPI and OpenMPLongest common subsequence (LCS)Parallel algorithms for LCSTool for finding LCS
医学主题词 算法(Algorithms);动物(Animals);碱基序列(Base Sequence);蜂(Bees);计算生物学(Computational Biology);人类(Humans);序列比对(Sequence Alignment);序列分析, DNA(Sequence Analysis, DNA);序列同源性, 核酸(Sequence Homology, Nucleic Acid);软件(Software);鸮形目(Strigiformes);病毒(Viruses)
DOI 10.1186/s13104-019-4256-6
PMID 30971295
发布时间 2020-02-25
提交
  • 浏览13
BMC research notes

BMC research notes

2019年12卷1期

220页

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