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Two data pre-processing workflows to facilitate the discovery of biomarkers by 2D NMR metabolomics.

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第一作者： Baptiste,Féraud

第一单位： Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA), Université Catholique de Louvain (UCL), Voie du Roman Pays 20, bte L1.04.01, 1348, Louvain-la-Neuve, Belgium. baptiste.feraud@uclouvain.be.;Machine Learning Group, Université Catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium. baptiste.feraud@uclouvain.be.

作者： Baptiste,Féraud ^[1] ; Justine,Leenders ^[2] ; Estelle,Martineau ^[3] ; Patrick,Giraudeau ^[4] ; Bernadette,Govaerts ^[5] ; Pascal,de Tullio ^[2]

作者单位： Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA), Université Catholique de Louvain (UCL), Voie du Roman Pays 20, bte L1.04.01, 1348, Louvain-la-Neuve, Belgium. baptiste.feraud@uclouvain.be.;Machine Learning Group, Université Catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium. baptiste.feraud@uclouvain.be. ^[1] Center for Interdisciplinary Research on Medicines (CIRM), Metabolomics group, Université de Liège (ULg), Liege, Belgium. ^[2] EBSI Team, Chimie et Interdisciplinarité, Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), CNRS, UMR 6230, Université de Nantes, Nantes, France.;Spectromaîtrise, CAPACITES SAS, 26 Bd Vincent Gâche, 44200, Nantes, France. ^[3] EBSI Team, Chimie et Interdisciplinarité, Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), CNRS, UMR 6230, Université de Nantes, Nantes, France.;Institut Universitaire de France, 1 rue Descartes, 75005, Paris Cedex 5, France. ^[4] Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA), Université Catholique de Louvain (UCL), Voie du Roman Pays 20, bte L1.04.01, 1348, Louvain-la-Neuve, Belgium. ^[5]

关键词 1H-NMR 2D NMR Biomarker discovery COSY spectra L-sOPLS Metabolomic informative content (MIC)PLS Pre-prossessing workflows sPLS

医学主题词算法(Algorithms);计算生物学(Computational Biology);磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging);磁共振波谱学(Magnetic Resonance Spectroscopy);代谢组学(Metabolomics);软件(Software);工作流(Workflow)

DOI 10.1007/s11306-019-1524-3

PMID 30993405

发布时间 2020-04-27

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