FastqCleaner: an interactive Bioconductor application for quality-control, filtering and trimming of FASTQ files.

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第一作者： Leandro Gabriel,Roser

第一单位： Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín - CONICET, 25 de Mayo 1401, B1650HMP, San Martín, Buenos Aires, Argentina. learoser@gmail.com.

作者： Leandro Gabriel,Roser ^[1] ; Fernán,Agüero ^[2] ; Daniel Oscar,Sánchez ^[3]

作者单位： Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín - CONICET, 25 de Mayo 1401, B1650HMP, San Martín, Buenos Aires, Argentina. learoser@gmail.com. ^[1] Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín - CONICET, 25 de Mayo 1401, B1650HMP, San Martín, Buenos Aires, Argentina. ^[2] Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín - CONICET, 25 de Mayo 1401, B1650HMP, San Martín, Buenos Aires, Argentina. dsanchez21@gmail.com. ^[3]

关键词 Bioconductor FASTQ Next generation sequencing R Shiny User-friendly tool Visualization Web app

主题词计算生物学(Computational Biology);高通量核苷酸序列分析(High-Throughput Nucleotide Sequencing);人类(Humans);质量控制(Quality Control);软件(Software);用户计算机接口(User-Computer Interface);工作流(Workflow)

DOI 10.1186/s12859-019-2961-8

PMID 31253077

发布时间 2020-02-25

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