Integrated genomic epidemiology and phenotypic profiling of Clostridium difficile across intra-hospital and community populations in Colombia.

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作者： Marina,Muñoz ^[1] ; Daniel,Restrepo-Montoya ^[2] ; Nitin,Kumar ^[1] ; Gregorio,Iraola ^[3] ; Milena,Camargo ^[4] ; Diana,Díaz-Arévalo ^[5] ; Nelly S,Roa-Molina ^[6] ; Mayra A,Tellez ^[7] ; Giovanny,Herrera ^[8] ; Dora I,Ríos-Chaparro ^[7] ; Claudia,Birchenall ^[9] ; Darío,Pinilla ^[10] ; Juan M,Pardo-Oviedo ^[11] ; Giovanni,Rodríguez-Leguizamón ^[11] ; Diego F,Josa ^[1] ; Trevor D,Lawley ^[12] ; Manuel A,Patarroyo ^[1] ; Juan David,Ramírez ^[13]

作者单位： Grupo de Investigaciones Microbiológicas-UR (GIMUR), Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Naturales y Matemáticas, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia. ^[1] Posgrado Interfacultades Doctorado en Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, Colombia. ^[2] Genomics and Bioinformatics Department, North Dakota State University, Fargo, North Dakota, USA. ^[3] Host-Microbiota Interactions Laboratory, Wellcome Sanger Institute, Hinxton, UK. ^[4] Microbial Genomics Laboratory, Institut Pasteur Montevideo, Montevideo, Uruguay. ^[5] Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Santiago de Chile, Chile. ^[6] Molecular Biology and Immunology Department, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia. ^[7] School of Medicine and Health Sciences, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia. ^[8] Faculty of Animal Sciences, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (UDCA), Bogotá, Colombia. ^[9] Hygea group, Faculty of Health Sciences, Universidad de Boyacá, Tunja, Colombia. ^[10] Centro de Investigaciones Odontológicas, Facultad de Odontología, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, Colombia. ^[11] PhD Programme in Biomedical and Biological Sciences, Faculty of Natural Sciences and Mathematics/School of Medicine and Health Sciences, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia. ^[12] Hospital Universitario Mayor - Méderi, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia. ^[13] Fundación Clínica Shaio, Bogotá, Colombia. ^[14] Grupo de Investigaciones Microbiológicas-UR (GIMUR), Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Naturales y Matemáticas, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia. juand.ramirez@urosario.edu.co. ^[15]