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LEGO-based generalized set of two linear algebraic 3D bio-macro-molecular descriptors: Theory and validation by QSARs.

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第一作者： Yovani,Marrero-Ponce

第一单位： Universidad San Francisco de Quito (USFQ), Grupo de Medicina Molecular y Traslacional (MeM&T), Colegio de Ciencias de la Salud (COCSA), Escuela de Medicina, Edificio de Especialidades Médicas, Av. Interoceánica Km 12 ½ -Cumbayá, Quito 170157, Ecuador; Grupo GINUMED, Corporacion Universitaria Rafal Nuñez. Facultad de Salud. Programa de Medicina, Cartagena, Colombia; Unidad de Investigación de Diseño de Fármacos y Conectividad Molecular, Departamento de Química Física, Facultad de Farmacia, Universitat de València, Valencia, Spain. Electronic address: ymarrero@usfq.edu.ec.

作者： Yovani,Marrero-Ponce ^[1] ; Julio E,Teran ^[2] ; Ernesto,Contreras-Torres ^[3] ; César R,García-Jacas ^[4] ; Yunierkis,Perez-Castillo ^[5] ; Nestor,Cubillan ^[6] ; Facundo,Peréz-Giménez ^[7] ; José R,Valdés-Martini ^[8]

作者单位： Universidad San Francisco de Quito (USFQ), Grupo de Medicina Molecular y Traslacional (MeM&T), Colegio de Ciencias de la Salud (COCSA), Escuela de Medicina, Edificio de Especialidades Médicas, Av. Interoceánica Km 12 ½ -Cumbayá, Quito 170157, Ecuador; Grupo GINUMED, Corporacion Universitaria Rafal Nuñez. Facultad de Salud. Programa de Medicina, Cartagena, Colombia; Unidad de Investigación de Diseño de Fármacos y Conectividad Molecular, Departamento de Química Física, Facultad de Farmacia, Universitat de València, Valencia, Spain. Electronic address: ymarrero@usfq.edu.ec. ^[1] Universidad San Francisco de Quito (USFQ), Grupo de Medicina Molecular y Traslacional (MeM&T), Colegio de Ciencias de la Salud (COCSA), Escuela de Medicina, Edificio de Especialidades Médicas, Av. Interoceánica Km 12 ½ -Cumbayá, Quito 170157, Ecuador; Universidad San Francisco de Quito (USFQ), Grupo de Química Computacional y Teórica, Departamento de Ingeniería Química, Diego de Robles y vía Interoceánica, Quito, 170157, Pichincha, Ecuador. ^[2] Computer-Aided Molecular "Biosilico" Discovery and Bioinformatics Research International Network (CAMD-BIR IN), Cumbayá, Quito, Ecuador; Universidad San Francisco de Quito (USFQ), Grupo de Medicina Molecular y Traslacional (MeM&T), Colegio de Ciencias de la Salud (COCSA), Escuela de Medicina, Edificio de Especialidades Médicas, Av. Interoceánica Km 12 ½ -Cumbayá, Quito 170157, Ecuador. ^[3] Cátedras Conacyt - Departamento de Ciencias de la Computación, Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada (CICESE), Ensenada, Baja California, México. ^[4] Bio-Chemoinformatics Research Group and Escuela de Ciencias Físicas y Matemáticas. Universidad de Las Américas, Quito 170504. Ecuador. ^[5] Programa de Química, Facultad de Ciencias Básicas, Universidad del Atlántico, Barranquilla, Colombia. ^[6] Unidad de Investigación de Diseño de Fármacos y Conectividad Molecular, Departamento de Química Física, Facultad de Farmacia, Universitat de València, Valencia, Spain. ^[7] StreelBridge Laboratories, SteelBridge Consulting Technology Solutions. Miami, FL 33183 United States. ^[8]

关键词 3D-protein descriptor Aggregation operator Amino acid interaction Folding rate Machine learning Metrics Normalization procedure Protein structural classes Two-linear algebraic forms

医学主题词氨基酸类(Amino Acids);线性模型(Linear Models);蛋白质类(Proteins);量化构效关系(Quantitative Structure-Activity Relationship);软件(Software)

DOI 10.1016/j.jtbi.2019.110039

PMID 31589877

发布时间 2021-05-26

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