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De novo 3D models of SARS-CoV-2 RNA elements from consensus experimental secondary structures.

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作者： Ramya,Rangan ^[1] ; Andrew M,Watkins ^[2] ; Jose,Chacon ^[2] ; Rachael,Kretsch ^[1] ; Wipapat,Kladwang ^[2] ; Ivan N,Zheludev ^[2] ; Jill,Townley ^[3] ; Mats,Rynge ^[4] ; Gregory,Thain ^[5] ; Rhiju,Das ^[1]

作者单位： Biophysics Program, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA. ^[1] Department of Biochemistry, Stanford University School of Medicine, Stanford CA 94305, USA. ^[2] Eterna Massive Open Laboratory. ^[3] Information Sciences Institute, University of Southern California, Marina Del Rey, CA 90292, USA. ^[4] Department of Computer Sciences, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706 USA. ^[5] Department of Physics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA. ^[6]

主题词 3'非翻译区(3' Untranslated Regions);5'非翻译区(5' Untranslated Regions);算法(Algorithms);适体, 核苷(Aptamers, Nucleotide);碱基序列(Base Sequence);结合部位(Binding Sites);多数赞同(Consensus);冷冻电子显微镜检查(Cryoelectron Microscopy);药物评价, 临床前(Drug Evaluation, Preclinical);移码, 核糖体(Frameshifting, Ribosomal);基因组, 病毒(Genome, Viral);模型, 分子(Models, Molecular);核酸构象(Nucleic Acid Conformation);RNA稳定性(RNA Stability);RNA, 病毒(RNA, Viral);结果可重复性(Reproducibility of Results);核糖开关(Riboswitch);小分子化合物库(Small Molecule Libraries)

DOI 10.1093/nar/gkab119

PMID 33693814

发布时间 2023-11-11

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Nucleic acids research

Nucleic acids research

2021年49卷6期

3092-3108页

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