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Disk compression of k-mer sets.

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第一作者： Amatur,Rahman

第一单位： Penn State University, State College, PA, USA. aur1111@psu.edu.

作者： Amatur,Rahman ^[1] ; Rayan,Chikhi ^[2] ; Paul,Medvedev ^[3]

作者单位： Penn State University, State College, PA, USA. aur1111@psu.edu. ^[1] Department of Computational Biology, C3BI USR 3756 CNRS, Institut Pasteur, Paris, France. ^[2] Penn State University, State College, PA, USA. ^[3]

关键词 Compression De Bruijn graphs Spectrum-preserving string sets k-mer sets

DOI 10.1186/s13015-021-00192-7

PMID 34154632

发布时间 2024-04-23

基金项目

T32 GM102057/GM/NIGMS NIH HHS/United States CBIOS training grant/NH/NIH HHS/United States

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Algorithms for molecular biology

2021年16卷1期

10页

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