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Chromatin loop anchors predict transcript and exon usage.

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作者： Yu,Zhang ^[1] ; Yichao,Cai ^[2] ; Xavier,Roca ^[3] ; Chee Keong,Kwoh ^[1] ; Melissa Jane,Fullwood ^[2]

作者单位： School of Computer Science and Engineering, Nanyang Technological University, 50 Nanyang Avenue, Singapore, 639798, Singapore. ^[1] Cancer Science Institute of Singapore, National University of Singapore, 14 Medical Dr, Singapore 117599, Singapore. ^[2] School of Biological Sciences, Nanyang Technological University, 60 Nanyang Dr, Singapore 637551, Singapore. ^[3] School of Biological Sciences, Nanyang Technological University, 637551, Singapore. ^[4] Institute of Molecular and Cell Biology, Agency for Science, Technology and Research (A*STAR), 61 Biopolis Dr, Singapore 138673, Singapore. ^[5]

关键词 ChIA-PET alternative splicing chromatin loop anchors exon usage gene expression histone modifications machine learning transcript

主题词染色质(Chromatin);染色质组装和分解(Chromatin Assembly and Disassembly);计算生物学(Computational Biology);DNA甲基化(DNA Methylation);后成说, 遗传(Epigenesis, Genetic);表观基因组学(Epigenomics);外显子(Exons);基因表达调控(Gene Expression Regulation);组蛋白类(Histones);模型, 生物学(Models, Biological);结果可重复性(Reproducibility of Results);转录, 遗传(Transcription, Genetic)

DOI 10.1093/bib/bbab254

PMID 34263910

发布时间 2022-03-11

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Briefings in bioinformatics

Briefings in bioinformatics

2021年22卷6期

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