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首页> BMC bioinformatics> LaRA 2: parallel and vectorized program for sequence-structure alignment of RNA sequences.

LaRA 2: parallel and vectorized program for sequence-structure alignment of RNA sequences.

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第一作者： Jörg,Winkler
第一单位： Department of Mathematics and Computer Science, Free University Berlin, Takustraße 9, 14195, Berlin, Germany. j.winkler@fu-berlin.de.;Max Planck Institute for Molecular Genetics, Ihnestraße 63-73, 14195, Berlin, Germany. j.winkler@fu-berlin.de.
作者： Jörg,Winkler [1] ; Gianvito,Urgese [2] ; Elisa,Ficarra [3] ; Knut,Reinert [4]
作者单位： Department of Mathematics and Computer Science, Free University Berlin, Takustraße 9, 14195, Berlin, Germany. j.winkler@fu-berlin.de.;Max Planck Institute for Molecular Genetics, Ihnestraße 63-73, 14195, Berlin, Germany. j.winkler@fu-berlin.de. [1] Interuniversity Department of Regional and Urban Studies and Planning, Politecnico di Torino, C.so Duca degli Abruzzi 24, 10129, Turin, Italy. [2] Department of Control and Computer Science, Politecnico di Torino, C.so Duca degli Abruzzi 24, 10129, Turin, Italy. [3] Department of Mathematics and Computer Science, Free University Berlin, Takustraße 9, 14195, Berlin, Germany.;Max Planck Institute for Molecular Genetics, Ihnestraße 63-73, 14195, Berlin, Germany. [4]
关键词 AlgorithmsBioinformaticsInteger linear programParallel computingRNARNA secondary structureStructural alignment
医学主题词 算法(Algorithms);碱基序列(Base Sequence);人类(Humans);核酸构象(Nucleic Acid Conformation);RNA(RNA);序列比对(Sequence Alignment);序列分析, RNA(Sequence Analysis, RNA);软件(Software)
DOI 10.1186/s12859-021-04532-7
PMID 34991448
发布时间 2023-11-05
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BMC bioinformatics

BMC bioinformatics

2022年23卷1期

18页

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