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Sketching and sampling approaches for fast and accurate long read classification.

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第一作者： Arun,Das

第一单位： Department of Computer Science, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21218, USA. arun.das@jhu.edu.

作者： Arun,Das ^[1] ; Michael C,Schatz ^[2]

作者单位： Department of Computer Science, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21218, USA. arun.das@jhu.edu. ^[1] Department of Computer Science, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21218, USA. ^[2]

关键词 Classification Metagenomics MinHash Sampling Sketching

医学主题词序列分析, DNA(Sequence Analysis, DNA);高通量核苷酸序列分析(High-Throughput Nucleotide Sequencing);软件(Software);宏基因组学(Metagenomics);宏基因组(Metagenome);算法(Algorithms)

DOI 10.1186/s12859-022-05014-0

PMID 36316646

发布时间 2023-03-29

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BMC bioinformatics

2022年23卷1期

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