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首页> Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)> A Primer on Preprocessing, Visualization, Clustering, and Phenotyping of Barcode-Based Spatial Transcriptomics Data.

A Primer on Preprocessing, Visualization, Clustering, and Phenotyping of Barcode-Based Spatial Transcriptomics Data.

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第一作者： Oscar,Ospina
第一单位： Department of Biostatistics and Bioinformatics, Moffitt Cancer Center, Tampa, FL, USA.
作者： Oscar,Ospina [1] ; Alex,Soupir [1] ; Brooke L,Fridley [2]
作者单位： Department of Biostatistics and Bioinformatics, Moffitt Cancer Center, Tampa, FL, USA. [1] Department of Biostatistics and Bioinformatics, H. Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute, Tampa, FL, USA. Brooke.Fridley@Moffitt.org. [2]
关键词 Cell phenotypingCell-type deconvolutionClusteringGene expressionSpatial dependencySpatially resolved transcriptomicsTissue microenvironment
主题词 聚类分析(Cluster Analysis);基因表达谱(Gene Expression Profiling);序列分析, RNA(Sequence Analysis, RNA);单细胞分析(Single-Cell Analysis)
DOI 10.1007/978-1-0716-2986-4_7
PMID 36929076
发布时间 2023-06-08
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  • 浏览0
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

2023年2629卷

115-140页

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