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首页> Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)> Ocean to Tree: Leveraging Single-Molecule RNA-Seq to Repair Genome Gene Models and Improve Phylogenomic Analysis of Gene and Species Evolution.

Ocean to Tree: Leveraging Single-Molecule RNA-Seq to Repair Genome Gene Models and Improve Phylogenomic Analysis of Gene and Species Evolution.

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作者： Jan,Hsiao ^[1] ; Lola Chenxi,Deng ^[1] ; Leonid L,Moroz ^[2] ; Sreekanth H,Chalasani ^[1] ; Eric,Edsinger ^[1]

作者单位： Molecular Neurobiology Laboratory, Salk Institute for Biological Study, La Jolla, CA, USA. ^[1] Whitney Laboratory for Marine Bioscience, University of Florida, St. Augustine, FL, USA.;Department of Neuroscience and McKnight Brain Institute, University of Florida, Gainesville, FL, USA. ^[2]

关键词 Ctenophora De novo transcriptome Gene family tree Mechanosensitive ion channels Mnemiopsis Phylogenetic trees Phylogenomics Piezo Single-molecule sequencing PacBio SMRT

主题词动物(Animals);种系发生(Phylogeny);进化, 分子(Evolution, Molecular);栉水母动物门(Ctenophora);基因组(Genome);计算生物学(Computational Biology);软件(Software);基因组学(Genomics);模型, 遗传学(Models, Genetic)

DOI 10.1007/978-1-0716-3642-8_19

PMID 38668979

发布时间 2025-01-05

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Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

461-490页

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