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首页> BMC bioinformatics> GRAMEP: an alignment-free method based on the maximum entropy principle for identifying SNPs.

GRAMEP: an alignment-free method based on the maximum entropy principle for identifying SNPs.

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第一作者： Matheus Henrique,Pimenta-Zanon
第一单位： Computer Science Department, Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR), Alberto Carazzai, 1640, Cornélio Procópio, Paraná, 86300-000, Brazil.
作者： Matheus Henrique,Pimenta-Zanon [1] ; André Yoshiaki,Kashiwabara [1] ; André Luís Laforga,Vanzela [2] ; Fabricio Martins,Lopes [3]
作者单位： Computer Science Department, Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR), Alberto Carazzai, 1640, Cornélio Procópio, Paraná, 86300-000, Brazil. [1] Laboratory of Cytogenetics and Plant Diversity, Department of General Biology, Universidade Estadual de Londrina (UEL), Rodovia Celso Garcia Cid, PR-445, Km 380, Londrina, Paraná, 86057-970, Brazil. [2] Computer Science Department, Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR), Alberto Carazzai, 1640, Cornélio Procópio, Paraná, 86300-000, Brazil. fabricio@utfpr.edu.br. [3]
关键词 Alignment-free methodsClassification of biological sequencesGenomic data analysisPrinciple of maximum entropySNP mutation identification
医学主题词 多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide);熵(Entropy);人类(Humans);基因组, 病毒(Genome, Viral);软件(Software);算法(Algorithms);序列分析, DNA(Sequence Analysis, DNA);高通量核苷酸序列分析(High-Throughput Nucleotide Sequencing);计算生物学(Computational Biology)
DOI 10.1186/s12859-025-06037-z
PMID 40000933
发布时间 2025-05-10
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BMC bioinformatics

BMC bioinformatics

2025年26卷1期

66页

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