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首页> ACS synthetic biology> Models and Algorithms for Equilibrium Analysis of Mixed-Material Nucleic Acid Systems.

Models and Algorithms for Equilibrium Analysis of Mixed-Material Nucleic Acid Systems.

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第一作者： Avinash,Nanjundiah
第一单位： Division of Biology & Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, United States.
作者： Avinash,Nanjundiah [1] ; Mark E,Fornace [2] ; Samuel J,Schulte [1] ; Niles A,Pierce [3]
作者单位： Division of Biology & Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, United States. [1] Division of Biology & Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, United States.;Applied Mathematics & Computational Research Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, California 94720, United States. [2] Division of Biology & Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, United States.;Division of Engineering & Applied Science, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, United States. [3]
关键词 2′OMe-RNABoltzmann-sampled secondary structuresDNANUPACKRNAchimeric casecomplex ensemblecomplex partition functiondynamic programming algorithmequilibrium base-pairing probabilitiesequilibrium complex concentrationshybrid caseminimum free energy secondary structuremixed materialssalt correctionsodiumtest tube ensemble
医学主题词 算法(Algorithms);RNA(RNA);DNA(DNA);软件(Software);碱基配对(Base Pairing);热力学(Thermodynamics);核酸构象(Nucleic Acid Conformation)
DOI 10.1021/acssynbio.5c00470
PMID 41498525
发布时间 2026-01-16
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ACS synthetic biology

ACS synthetic biology

2026年15卷1期

74-87页

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