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首页> Briefings in bioinformatics> The sequence alignment problem: boundary conditions as the unifying principle.

The sequence alignment problem: boundary conditions as the unifying principle.

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第一作者： Paul A,Gagniuc
第一单位： Faculty of Engineering in Foreign Languages, National University of Science and Technology Politehnica Bucharest, Department of Engineering in Foreign Languages, 313 Splaiul Independenței, 5th District, Bucharest RO-060042, Romania.
作者： Paul A,Gagniuc [1] ; Elvira,Gagniuc [2]
作者单位： Faculty of Engineering in Foreign Languages, National University of Science and Technology Politehnica Bucharest, Department of Engineering in Foreign Languages, 313 Splaiul Independenței, 5th District, Bucharest RO-060042, Romania. [1] Faculty of Veterinary Medicine, University of Agronomic Sciences and Veterinary Medicine, Department of Paraclinical Sciences, 105 Splaiul Independenței, 5th District, Bucharest RO-050097, Romania. [2]
关键词 FPGA acceleratorGPU accelerationNeedleman–WunschSmith–Watermanaffine gap modelalgorithm optimizationdynamic programinggenomic analysisglobal alignmentlocal alignmentmetagenomic analysisprivacy-preserving computationprotein domain analysisscoring theoryseed-extend methodsequence alignmentsparse DPsubstitution matrixvariant discovery
医学主题词 算法(Algorithms);序列比对(Sequence Alignment);人类(Humans)
DOI 10.1093/bib/bbag333
PMID 42323877
发布时间 2026-06-30
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Briefings in bioinformatics

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2026年27卷3期

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