基于生物信息学的慢性肾脏病合并心肌梗死的机制研究
Mechanism study of chronic kidney dysfunction combined with myocardial infarction based on bioinformatics
摘要目的:探讨慢性肾脏病(CKD)患者发生心肌梗死(MI)的潜在机制.方法:下载GSE125898基因芯片数据集,使用R语言软件筛选CKD合并MI的差异表达基因,运用加权基因共表达网络分析筛选与CKD合并MI相关的基因模块,获得CKD合并MI相关的基因并构建蛋白-蛋白相互作用网络,筛选CKD合并MI的核心基因并进行京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析.结果:筛选获得CKD合并MI的差异表达基因438个,其中上调基因232个,下调基因206个;筛选获得129个CKD合并MI相关的基因,其中CXCR4、HDAC2、PTGS2、F2和CCL5是CKD合并MI的核心基因.富集分析结果表明,CKD合并MI的核心基因显著富集在肿瘤坏死因子(TNF)和趋化因子信号通路上.结论:CKD合并MI的发病涉及TNF、趋化因子等信号通路;CXCR4、PTGS2、CCL5、F2和HDAC2是CKD合并MI发病的核心基因.
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