应用质谱技术检测结肠癌细胞DPYD和MTHFR基因单核苷酸多态性

Detection of single nucleotide polymorphisms of DPYD and MTHFR genes in colon cancer cell lines

二维码有效期 120s

摘要目的:检测结肠癌细胞株中两种代谢相关基因DPYD和MTHFR的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs).方法:培养HT-29及Lovo两株结肠癌细胞,分别提取基因组DNA,PCR扩增DPYD和MTHFR基因相应目的片段,采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术进行DPYD因rs1801159(A/G)、rs1801160(G/A)、rs17376848(A/G),MTHF基因rs1801131 (A/C)、rs1801133 (C/T)、rs2274976 (G/A)的SNPs位点检测.结果:两种细胞的DPYD基因3个位点rs1801159、rs1801160及rs17376848基因型均为野生纯合型,即A/A、G/G及A/A型.HT-29细胞MTHFR基因rs1801131和rs1801133、rs2274976位点基因型分别为A/C、C/T杂合子和G/G纯合子,而Lovo细胞此3个位点依次为A/A、T/T纯合子和G/A杂合子.结论:本实验中HT-29及Lovo两种细胞株的DPYD基因所测3个SNP位点基因型均相同,而这两种结肠癌细胞株MTHFR基因所测的各SNP位点基因型均不相同.

作者陈宝安 ^[1] 张文静 ^[1] 张孝平 ^[1] 柏志斌 ^[2] 冯继峰 ^[3] 仲悦娇 ^[3] 丁家华 ^[1] 高冲 ^[1] 鲍文 ^[1] 彭苗新 ^[1] 程璐 ^[4] 陆祖宏 ^[4] 学术成果认领

作者单位东南大学医学院附属中大医院血液肿瘤科,江苏省医学重点学科,江苏南京210009 ^[1] 东南大学医学院附属中大医院普外科,江苏南京,210009 ^[2] 江苏省肿瘤研究所,江苏南京,210009 ^[3] 东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室,江苏南京,210096 ^[4]

关键词结肠癌单核苷酸多态性 DPYD MTHFR

主题词结肠肿瘤(Colonic Neoplasms)细胞(Cells)多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide)基因(Genes)基因型(Genotype)

分类号 Q754

栏目名称论著

DOI 10.3969/j.issn.1004-616x.2012.02.004

发布时间 2012-07-31

基金项目

国家自然科学基金 江苏省科技厅重大项目