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珠颈斑鸠线粒体12S rRNA基因的克隆·测序和分子进化分析

Cloning,Sequencing and Molecular Evolution Analysis of Mitochondrial 12S rRNA Gene in Streptopelia chinensis

摘要[目的]获得珠颈斑鸠(Streptopelia chinensis)线粒体12S rRNA基因序列,并以此分析不同鸟类的分子进化关系.[方法]根据其他鸟类线粒体12S rRNA基因及侧翼序列设计引物,采用PCR的方法获得珠颈斑鸠线粒体12S rRNA基因片段,克隆后进行序列测定,利用Mega 4.0软件Neighbor-Joining法分析不同鸟类的进化关系.[结果]获得珠颈斑鸠线粒体12S rRNA基因序列长度为970 bp,碱基组成为:A=31.6%、C=28.9%、G=19.8%、T=19.7%,其中A+T含量高于G+C含量.通过与GenBank中环颈斑鸠(Streptopelia capicola)等其他8种鸟类12S rRNA基因序列比较发现,珠颈斑鸠与环颈斑鸠的同源性最高,为94.4%,与家鸭(Anas platyrhynchos)的同源性最低,为78.4%.并根据这9种鸟类序列用NJ法构建进化树,结果表明,珠颈斑鸠和其他8种鸟类在分子水平上反映的进化关系与在形态学上的进化关系基本吻合.[结论]首次得到珠颈斑鸠12S rRNA基因全长序列,并确定了珠颈斑鸠与其他8种鸟类的分子进化关系.

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