换一批河豚4SNc-Tudor蛋白的鉴定及生物信息分析
Characterization and Bioinformatics Analysis of 4SNc-Tudor Domain Protein of Takifugu rubripes
摘要[目的]对河豚4SNc-Tudor蛋白(SN4TDR)进行序列与结构相关的生物信息分析,为认识该蛋白结构与功能提供借鉴.[方法]应用双向电泳及基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白.并对其进行生物信息学分析.[结果]首次从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白SN4TDR.河豚SN4TDR定位于细胞质,无信号肽,为非分泌蛋白,有多个磷酸化位点.蛋白SN4TDR存在α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构,有一个可能形成跨膜结构的片段.并用同源建模的方法,预测了河豚SN4TDR的三维结构模型.[结论]分析河豚SN4TDR基因及蛋白结构,有助于进一步研究该蛋白及其基因的分子和生物学功能.
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分类号
S188
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.0517-6611.2010.03.025
发布时间
2010-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
江苏省高等学校自然科学研究项目（08KJD180008）
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