纳升液相色谱-飞行时间质谱鉴定HaCaT细胞膜蛋白
Nano High Performance Liquid Chromatography Coupling with Time-of-flight Mass Spectrometer for Identification of Membrane Proteins in HaCaT Cells
摘要[目的]探讨通过纳升液相色谱-飞行时间质谱检测人永生化表皮细胞的膜蛋白质的方法.[方法]对人永生化表皮细胞进行贴壁培养,然后对处于对数生长期细胞的膜蛋白进行提取、富集和酶解,用nano-HPLC-TOF/TOF-MS对蛋白质进行鉴定,最后用生物信息学技术对鉴定蛋白进行分析和归类.[结果]在鉴定的15个蛋白中,与细胞膜相关的蛋白有9个,占比例的60%.生物信息学分析表明,这些蛋白在分子功能上主要涉及催化,结构分子活性和结合;在生物学进程上,这些蛋白主要归类为代谢,细胞成分形成和细胞生物进程等.[结论]纳升色谱-飞行时间质谱是鉴定膜蛋白的有效方法.
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