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人Smac基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

摘要目的 分析线粒体促凋亡蛋白 (Smac)基因启动子区结合蛋白,预测其转录调控因子.方法 从基因参考序列数据库获取Smac基因启动子区序列,使用TFSEARCH程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测.结果 成功获得了长度为2 kb的人Smac基因启动子区序列.该启动子区Threshold score≥90的共有71个转录因子结合位点,涉及STAT家族、bZIP家族、叉头蛋白家族、锌指蛋白Kruppel家族、POU家族、runt家族、MYB家族、GATA结合蛋白家族、SOX家族、同源异型框基因家族10个家族的转录因子和1个TATA box.结论 Smac表达的调控是在一定时间或空间上、一种或多种调节蛋白作用的复杂过程.调控Smac的转录因子绝大部分与胚胎发育、性别决定、个体生长密切相关.

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