HNF4A在胃癌中的表达及多数据库分析和实验研究

Multi-database analysis and experimental study on the expression of HNF4A in gastric cancer

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摘要目的探讨肝细胞核因子4A(HNF4A)在胃癌中的表达、预后及生物学作用,并研究其对胃癌细胞增殖的影响.方法肿瘤免疫分析2.0(TIMER2.0)和基因表达谱交互式分析(GEPIA2)数据库分析HNF4A在胃癌和正常组织中的表达差异,KM plotter分析HNF4A表达水平与胃癌患者生存率的相关性,TISIDB数据库和R语言4.1.2分析HNF4A是否参与胃癌免疫调节的过程,cBioPortal数据库分析HNF4A在胃癌中的突变情况,GSEA 4.2对HNF4A进行功能富集分析,LinkedOmics数据库预测HNF4A可能调控的基因.实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)、蛋白质印迹法(Western blot)和免疫组织化学(IHC)染色检测HNF4A在胃癌和癌旁组织中的相对表达量,细胞计数试剂盒-8(CCK-8)、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(EdU)、平板克隆和流式细胞周期检测胃癌细胞的增殖和细胞周期.结果 HNF4A在胃癌组织中表达升高(P<0.05),HNF4A高表达胃癌患者总生存率更差(P<0.001).HNF4A在胃癌中主要以错义突变为主.免疫细胞浸润发现HNF4A和B淋巴细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞都相关(P<0.001),HNF4A还和肿瘤突变负荷(r=0.28,P<0.0001)、微卫星不稳定性(r=0.13,P<0.01)相关.敲低HNF4A后,胃癌细胞的增殖能力明显减弱,诱导其细胞周期阻滞在G0/G1期.结论 HNF4A在胃癌组织中表达明显升高,并且与预后不良相关,还可能参与免疫调节过程,敲低HNF4A可以抑制胃癌细胞增殖.