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宏基因二代测序在肺部感染病原菌检测的应用

Application of metagenomic next-generation sequencing in the detection of pathogenic bacteria of pulmonary infection

摘要目的 分析研究宏基因二代测序技术(mNGS)在肺部感染病原菌检测中的应用价值,为临床诊断提供理论依据.方法 回顾性选取疑似肺部感染患者 161 例为研究对象,采集肺泡灌洗液标本、痰液、肺组织活检标本、胸水和血液同时进行常规培养、呼吸道病原体核酸检测及病原微生物mNGS检测,分别计算3 种检测方法的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,评估mNGS的临床应用价值.结果 161 例疑似肺部感染患者中,确定为肺部感染的有 113 例.入组的 161 例患者中,mNGS灵敏度、阴性预测值相比常规培养及呼吸道病原体核酸检测提高,差异有统计学意义(P<0.001).mNGS的特异度虽然高于呼吸道病原体核酸检测,但差异无统计学意义.mNGS阳性预测值最高,高于呼吸道病原体核酸检测,但是与常规培养相比差异无统计学意义.结论 mNGS在肺部感染病原微生物诊断中灵敏度均超过了常规培养及呼吸道病原体核酸检测,降低了诊断的假阴性率,综合评价较好;常规培养检测灵敏度低,但特异度较高;呼吸道病原体核酸检测灵敏度相较常规培养有所提高,但其特异度下降.

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作者 刘静 [1] 闫莉莉 [1] 赵淑贤 [1] 王永 [2] 郜玉峰 [3] 李家斌 [3] 王保贵 [1] 学术成果认领
作者单位 安徽医科大学附属阜阳市人民医院感染科,阜阳236000 [1] 阜阳市第五人民医院呼吸科,阜阳 236000 [2] 安徽医科大学第一附属医院感染科,合肥 230022 [3]
分类号 R563.1
栏目名称 临床医学研究
DOI 10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.06.029
发布时间 2023-08-07
基金项目
阜阳市自筹经费科技计划项目 安徽高校协同创新项目
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安徽医科大学学报

安徽医科大学学报

2023年58卷6期

1046-1050页

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