换一批
换一批基于单细胞核转录组测序的多发性大动脉炎外周血单个核细胞图谱分析
Analysis of peripheral blood mononuclear cells in Takayasu arteritis based on single cell nuclear transcriptome sequencing
摘要目的 基于单细胞核转录组测序(snRNA-seq)技术描绘多发性大动脉炎(TAK)外周血单个核细胞(PBMC)基因和功能的异质性改变,阐述TAK可能的免疫机制.方法 收集确诊为TAK患者的PBMC共6例为疾病组(TAK组),同期就诊的健康人群6例PBMC为正常组(NC组).基于snRNA-seq工作流程建库测序,下机数据采用R 3.6.2软件进行主成分分析(PCA)及t-分布随机邻域嵌入(tSNE)分析等手段对两组PBMC样本池的单个核细胞的基因表达进行检测.结果 TAK患者PBMC的免疫细胞的相对比例和含量都发生了改变;高克隆TCR可高度同源性匹配整合素beta-3的氨基酸序列;T细胞介导的干扰素γ和TNFα通路显著上调;TNFRSF13B+记忆B细胞比例明显升高;所有细胞类型中单核细胞所形成的的配体受体相互作用始终最多.结论 TAK的发生发展过程中PBMC参与了复杂的调节,多种免疫炎症因子异常表达,其中单核细胞在PBMC的相互作用中占据了重要地位.
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关键词
单细胞核转录组测序多发性大动脉炎外周血单个核细胞免疫single nuclei RNA sequencingtakayasu arteritisperipheral blood mononuclear cellimmunity
分类号
R654.4
栏目名称
临床医学研究
DOI
10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.06.024
发布时间
2024-08-01
基金项目
安徽高校自然科学研究项目
安徽医科大学校科研基金项目
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