动物双歧杆菌B4株的全基因组测序及其益生特性分析
Whole genome sequencing of Bifidobacterium animalis subsp.lactic B4 and analysis of its probiotic properties
摘要目的 分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性.方法 采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序以及基因功能注释.结果 经全基因组测序后显示该动物双歧杆菌B4株基因组大小为1 944 146 bp,GC含量为60.49%,不含质粒,总基因数为1 642个.体外实验分析结果显示,该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,包括非溶血性和耐胃酸的特性.同时基因组结果显示,该动物双歧杆菌B4株不具有毒素、致病相关基因,耐药基因少且传播能力不高,具有很高的安全性.通过KEGG、COG、GO等基因注释显示其含有很多生物活性酶,如β-半乳糖苷酶、L-乳酸脱氢酶等益生基因.结论 该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,在基因层面上展示了优良的安全性,具有益生特性的基因序列.
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