K39型肺炎克雷伯菌噬菌体IME330的生物学特性及基因组特性分析
Biological and genomic characterization of phage IME330 of Klebsiella pneumoniae type K39
摘要目的 从医院未经处理的污水中分离一株靶向K39型肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体,并系统分析其生物学特性及基因组学信息.方法 以基于荚膜多糖基因序列鉴定的K39型肺炎克雷伯菌Kp 1000为宿主菌,采用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离与纯化.通过负染法结合透射电子显微镜观察噬菌体的形态特征,利用噬斑法评估其裂菌谱.进一步测定噬菌体的最佳感染复数(MOI),完成一步生长曲线、温度及酸碱等耐受性实验,评估其生物学特性.最后,提取噬菌体DNA,利用Illu-mina HiSeq2000测序平台进行全基因组测序,并对测序结果进行注释与分析.结果 成功分离到一株特异性靶向K39型肺炎克雷伯菌的裂解性噬菌体,命名为IME330.透射电镜显示,该噬菌体头部直径为(75±1)nm,尾长为(185±1)nm.裂菌谱分析表明,IME330能裂解K39型肺炎克雷伯菌,显示出较窄的宿主范围和高度特异性.其最佳感染复数(MOI)为0.1,裂解量达168 PFU/cell.理化特性实验表明,IME330对高温及酸碱环境(pH 4~10)具有较强的耐受性.基因组分析显示,IME330基因组全长144 245 bp,分子量为46 463 MDa,G+C含量为44.8%,共编码320个开放阅读框.结论 IME330被鉴定为一株新型裂解性肺炎克雷伯菌噬菌体,隶属于有尾噬菌体目.该噬菌体对温度、酸碱等理化因素具有较强耐受性,且表现出高效的裂解能力,但其裂菌谱较窄,宿主特异性较高.
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