敲除IRF2BP2对急性髓系白血病细胞增殖的影响及机制研究
Investigation of the impact and mechanism of IRF2BP2 knockdown on the proliferation in acute myeloid leukemia cells
摘要目的 探索干扰素调节因子2结合蛋白2(IRF2BP2)对急性髓系白血病(AML)细胞增殖的影响及分子机制.方法 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术在人AML细胞株Kasumi-1和U937中敲除IRF2BP2,Western blot检测IRF2BP2蛋白的敲除效率.使用显微镜观察、CCK-8、集落形成实验和流式细胞仪检测细胞表型,RNA-Seq检测U937细胞株中IRF2BP2敲除组和对照组的差异基因,基因富集分析(GSEA)探讨其下游分子机制,Western blot检测下游差异基因的表达.使用靶向切割标签技术(CUT&Tag)鉴定IRF2BP2蛋白的直接靶点,并用集成基因组学查看器(IGV)可视化分析相应的结合信号.结果 与对照组相比,敲除IRF2BP2后,CCK-8实验显示AML细胞增殖受抑(P<0.05);IRF2BP2敲除组细胞集落数减少(P<0.05)、G1期比例延长(P<0.05);在U937细胞株中敲除IRF2BP2,差异基因显著富集到与髓细胞增生原癌基因(MYC)相关的信号通路,通路分子MYC、细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)和细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)的蛋白表达水平随IRF2BP2的下调而降低;使用IRF2BP2抗体在U937细胞株中进行CUT&Tag实验,IGV可视化分析显示MYC启动子区域存在显著的信号峰升高.结论 IRF2BP2蛋白通过靶向调控MYC影响AML细胞周期和细胞增殖.
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